Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms