Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli3Q61602 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms