Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd1Q61466 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms