Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms