Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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