Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms