Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Laptm4aQ60961 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Laptm4aQ60961 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms