Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms