Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa3Q60790 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasa3Q60790 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms