Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms