Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms