Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PmelQ60696 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms