Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sin3aQ60520 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms