Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms