Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms