Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tsr1Q5SWD9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms