Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms