Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scarf1Q5ND28 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms