Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms