Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms