Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp22Q5DU02 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms