Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms