Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chsy3Q5DTK1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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