Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2f8Q58FA4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms