Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
L1td1Q587J6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1td1Q587J6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms