Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
WhammQ571B6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WhammQ571B6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms