Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpjQ569L8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms