Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms