Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccnl1Q52KE7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnl1Q52KE7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms