Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opa3Q505D7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opa3Q505D7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms