Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf109Q499E6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms