Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms