Protein–RNA interactions for Protein: Q3V4B5

Commd6, COMM domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd6Q3V4B5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd6Q3V4B5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms