Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pydc3Q3V3Q4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pydc3Q3V3Q4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms