Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Esf1Q3V1V3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Esf1Q3V1V3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms