Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms