Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp48Q3V0C5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Usp48Q3V0C5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Usp48Q3V0C5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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