Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms