Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms