Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nkain3Q3URJ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nkain3Q3URJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nkain3Q3URJ8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkain3Q3URJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Nkain3Q3URJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Nkain3Q3URJ8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nkain3Q3URJ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkain3Q3URJ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms