Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwa5b2Q3UR50 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms