Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
E130208F15RikQ3UPV3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms