Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms