Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CrxosQ3UL53 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms