Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKY7

Prss38, Serine protease 38, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss38Q3UKY7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prss38Q3UKY7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss38Q3UKY7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms