Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smu1Q3UKJ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms