Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp19Q3UJD6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms