Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dtx3lQ3UIR3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dtx3lQ3UIR3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms