Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed8Q3UHI4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed8Q3UHI4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms