Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LchnQ3UHG7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LchnQ3UHG7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms